Procjena genetskih parametara binomne varijable koristeći GLIMMIX SAS proceduru

diplomski rad

• Autor: Sara Matanović
• Mentor: Miroslav Kapš (mentor)
• Član povjerenstva: Miroslav Kapš (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ino Čurik (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Vlatka Čubrić Čurik (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Maja Ferenčaković (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Agronomski fakultet; (Opće stočarstvo); Zagreb
• Datum i država obrane: 2016-09-27, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: BIOTEHNIČKE ZNANOSTI; Poljoprivreda (agronomija); Genetika i oplemenjivanje bilja, životinja i mikroorganizama

Sažetak

Procijenjene su izvedbe različitih modela za analizu genetskih parametara binomne varijable.
Glavni cilj je bio metodološki prikazati neku binomnu varijablu, usporediti probit i logit
modele međusobno te s običnim linearnim modelom. Podatci su simulirani koristeći SAS 9.3
program. Simulirana su dva seta podataka, oba s 1000 bikova te 100 kćeri po svakome biku, a
razlikovala su se u proporciji binarne varijable koja je iznosila 0,2 za jedan set podatka te 0,5
za drugi set. Podatci su zatim obrađeni procedurama mixed za obični linearni model (model
očeva) i glimmix za uopćeni linearni mješoviti model. Na temelju dobivenih vrijednosti
izračunati su heritabiliteti te su uspoređene vrijednosti varijance očeva i varijance ostatka za
svaki od navedenih modela. Uočene su razlike između običnog linearnog te probit i logit
modela. Također su uočene razlike između probit i logit modela, ali nisu bile značajno velike.

Sažetak (engleski)

The performances of different models for genetic analysis of binomial variable have been
evaluated. The main goal was to methodologically show some binomial variable, compare the
probit and logit models mutually and with a linear model. The data were simulated using SAS
9.3 software. Two sets of data were simulated, both having 1000 bulls with a 100 daughters
for each bull. The data sets differed in the proportion of the binary variable that was 0,2 for
one data set and 0,5 for the other. The data were processed using proc mixed for linear model
(sire model) and proc glimmix for generalized linear mixed model. Based on the obtained
values heritability was calculated for each model. Also, the values of sire and error variances
were compared. Differences between linear model and probit and logit models were noticed.
Differences between probit and logit model were also noticed but were not significantly large.

• Ključne riječi: binomna varijabla; obični linearni model; probit model; logit model; heritabilitet
• Ključne riječi (engleski): binomial variable; linear model; probit model; logit model; heritability
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:204:096492
• Studijski program: Naziv: Genetika i oplemenjivanje životinja; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/ magistra inženjer/inženjerka genetike i oplemenjivanja životinja (mag. ing. agr.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2016-11-29 12:40:16