Molekularna i fenotipska karakterizacija autohtonih sojeva rizobija koje noduliraju slanutak (Cicer arietinum L.)

diplomski rad

• Naslov (engleski): Molecular and phenotypic characterization od indigenous rhizobial strains nodulating chickpea (Cicer arietinum L.)
• Autor: Petra Frančić
• Mentor: Sanja Sikora (mentor)
• Član povjerenstva: Sanja Sikora (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Mirna Mrkonjić Fuka (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Snježana Bolarić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Agronomski fakultet; (Mikrobiologija); Zagreb
• Datum i država obrane: 2022-09-29, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: BIOTEHNIČKE ZNANOSTI; Poljoprivreda (agronomija)

Sažetak

Simbiozni fiksatori dušika (rizobije) omogućuju unos značajnih količina biološki vezanog dušika u tlo stvarajući simbiozne odnose s brojnim leguminozama. Autohtoni sojevi rizobija često su vrlo kompetitivni radi dobre prilagodbe na različite uvjete u tlu. Selekcija visoko učinkovitih sojeva rizobija koje noduliraju slanutak jedan je od preduvjeta uspješne primjene inokulacije sjemena slanutka. S ciljem izolacije i odabira najkvalitetnijih autohtonih sojeva rizobija prikupljeni su uzorci tla s različitih područja uzgoja slanutka u Hrvatskoj i Hercegovini. Početna identifikacija provedena je sekvenciranjem 16S rRNA gena kojim je utvrđeno da većina izolata iz kvržica slanutka pripada rodovima Rhizobium, Mesorhizobium i Sinorhizobium. Uvid u biološku raznolikost i simbiozna svojstva izolata provedeno je sekvenciranjem nifH gena kojim je utvrđena velika varijabilnost između vrsta. Ispitivanjem fenotipskih karakteristika izolata utvrđena je značajna otpornost na različite nepovoljne čimbenike poput povišene temperature, povišene koncentracije NaCl-a, niske pH vrijednosti te in vitro tolerantnosti na sušu. Budući da se radi o početnim fazama istraživanja raznolikosti prirodnih populacija rizobija koje noduliraju slanutak, od izuzetne važnosti je dobivene izolate uključiti u daljnji program detaljne identifikacije i karakterizacije.

Sažetak (engleski)

Symbiotic nitrogen-fixing bacteria (rhizobia) enable the entry of significant amounts of biologically fixed nitrogen into the soil, creating symbiotic associations with numerous legumes. Indigenous rhizobial strains are often very competitive because of their good adaptation to different soil conditions. The selection of highly effective rhizobial strains nodulating chickpea is one of the preconditions for a successful application of chickpea inoculation. In order to isolate and select the highest quality of rhizobial strains, soil samples were collected from different areas of chickpea cultivation in Croatia and Herzegovina. Initial identification was conducted by sequencing the 16S rRNA gene and the results revealed that most of the chickpea isolates belonge to the genera Rhizobium, Mesorhizobium and Sinorhizobium. The insight into biodiversity and the symbiotic characteristics of the isolates was performed by sequencing the nifH gene which determined high variability between species. Phenotypic characterization of isolates revealed considerable resistance to unfavorable environmental conditions such as elevated temperature and NaCl concentration, low pH values and drought. In this paper, the initial results of studying biodiversity of indigenous chickpea rhizobia, are presented. Therefore, it is important to include the obtained strains in further programs of detailed identification and characterization.

• Ključne riječi: simbiozna fiksacija dušika; slanutak (Cicer arietinum L.); rizobije; 16S rRNA gen; nifH gen; fenotipske karakteristike
• Ključne riječi (engleski): symbiotic nitrogen fixation; chickpea (Cicer arietinum L.); rhizobia; 16S rRNA gene; nifH gene; phenotypic characteristics
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:204:484045
• Studijski program: Naziv: Agroekologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/ magistra inženjer/inženjerka agroekologije (mag. ing. agr.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2022-11-24 08:30:29